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RNA-EMSA（RNA-Electrophoretic Mobility Shift Assay）是一種快速靈敏的檢測蛋白-RNA互作的技術方法，RNA-EMSA是將標記的RNA與蛋白質共同孵育，當形成復合物后，通過非變性聚丙烯酰胺凝膠對RNA-蛋白質復合體進行電泳。

與游離的RNA探針相比，RNA-蛋白質復合體的遷移速度較慢，可以在凝膠上觀察到阻滯條帶。通過RNA-EMSA實驗可以檢測或驗證RNA與蛋白質的相互作用、蛋白質在RNA上的結合序列等。