技術服務
Technical service
- 技術簡介
基因表達在多個層面上受到調控，包括：表觀遺傳水平調控、轉錄水平調控、翻譯水平調控以及翻譯后修飾調控。其中，翻譯調控控制著蛋白質的生物合成以響應生理和病理的變化。而且，翻譯水平的調控也深刻影響了蛋白質的豐度。研究翻譯水平的調控機制，有助于深入理解基因表達調控機制，并且可以解釋轉錄組和蛋白質組分析之間的差異。
多聚核糖體分析（Polysome profiling）是研究翻譯調控機制常用的技術。Polysome profiling通過蔗糖密度梯度超速離心分離free mRNA、40S和60S核糖體亞基、單核糖體和多聚核糖體，收集含有多聚核糖體的部分用于RNA或蛋白質分析。也可以通過酶消化檢測disome。
Polysome profiling既可用于特定mRNA的靶向分析，也可用于整體分析。相對于Ribo-seq來說還可以獲得全長翻譯的mRNA，包括非翻譯區（UTRs），而UTRs含有調節選擇性翻譯的順式作用元件。鑒定與翻譯的mRNA亞型相對應的UTRs和保守的順式作用元件對于基因表達調控的機制分析至關重要。此外，多聚體分析可以與免疫印跡或蛋白質組學相結合，來監測與核糖體或起始復合物相關的蛋白質。最后，多聚體圖譜分析特別適用于缺少基因組數據或不可能進行基因操作的模式生物。
